Makoto und seine Freunde stehen einem neuen gefährlichen Gegner gegenüber: der Gruppe Strega rund um ihren charismatischen Anführer Takaya Sakai. Ihre Interessen sind komplett gegensätzlich zu denen der Schüler der Gekkoukan Akademie und somit finden sich Makoto, Yuakri und Junpei gefangen in einem aussichtslosen Kampf zwischen zwei Fronten. Wird es ihnen gelingen mit Hilfe ihrer Personas ihren Gegnern zu trotzen? Im zweiten Filme der Persona 3 - Reihe geht der Kampf gegen die Schatten an der Gekkoukan Akademie, basierend auf der erfolgreichen Videospielreihe von Atlus, in die nächste Runde.
